Vi khuẩn có thể hình thành các loại bào tử sau: nội bào tử, ngoại bào tử và bào tử đốt.
- Nội bào tử được hình thành khi gặp điều kiện bất lợi. Nội bào tử có vỏ dày, bên trong là hợp chất đặc biệt giúp cho bào tử rất bền nhiệt.- Bào tử đốt: bào tử được hình thành do sự phân đốt của sợi dinh dưỡng.- Ngoại bào tử: bào tử được hình thành bên ngoài tế bào sinh dưỡng.