* Hệ sinh thái tự nhiên :
- Sự khác nhau về thành phần cấu trúc :
+ Thành phần loài phong phú, số lượng cá thể nhiều..
+ Kích thước cá thể đa dạng, các cá thể có tuổi khác nhau...
+ Phân bố không gian nhiều tầng...
+ Hệ sinh thái có đủ sinh vật sản xuất, tiêu thụ và phân giải.
- Sự khác nhau về chu trình dinh dưỡng :
+ Lưới thức ăn phức tạp, tháp sinh thái có hình đáy rộng.
+ Tất cả thức ăn cho sinh vật đều được cung cấp bên trong hệ sinh thái.
- Sự khác nhau về chuyển hoá năng lượng . Năng lượng cung cấp chủ yếu từ Mặt Trời
* Hệ sinh thái nhân tạo :
- Sự khác nhau về thành phần cấu trúc :
+ Số lượng loài ít, số cá thể của mỗi loài nhiều...
+ Các loài có kích thước cơ thể, tuổi... gần bằng nhau.
- Sự khác nhau về chu trình dinh dưỡng :
+ Lưới thức ăn đơn giản có ít mắt xích, tháp sinh thái có hình đáy hẹp.
+ Một phần sản lượng sinh vật được thu hoạch mang ra ngoài hệ sinh thái.
- Sự khác nhau về chuyển hoá năng lượng : Ngoài năng lượng cung cấp từ Mặt Trời, hệ sinh thái còn được cung cấp thêm một phần sản lượng và năng lượng khác (ví dụ, phân bón...).